Ähnlich wie in C&C Generals, wo es die Kommandofähigkeiten für jede Partei gab, existieren in C&C Tiberium Wars auch spezielle Fähigkeiten für jede der drei Parteien.

Dabei besitzt jede Partei ihre einzigartigen Spezialfähigkeiten, die ein Spieler auf seine individuelle Spielweise anpassen kann.

A llerdings kann man die Spezialfähigkeiten der Aliens nur für Geld erwerben.

Geschützturm:

Ein Verteidigungsturm kann für 200$ auf dem Schlachtfeld an einem beliebigen Ort positioniert werden.

Wurmloch:

Ein Wurmloch dient dazu Einheiten ohne Überwindung von Raum und Zeit von einem zu einem anderen Ort zu transportieren. Mit dieser Fähigkeit der Aliens ist es möglich an zwei verschiedenen Punkten auf der Karte Wurmlöcher zu erschaffen und Einheiten zu durch das Wurmloch zu transportieren.

Allerdings ist es auch dem Gegner möglich das Wurmloch für seine Einheiten zu missbrauchen. 

 

Mutterschiff:

Das Mutterschiff, die mächtigste Waffe der Aliens kostet für die Aktivierung 5000$ und kann auf der Karte wie eine normale Einheit hin und her bewegt werden.  Durch die riesige Strahlenkanone ist das Mutterschiff eine sehr gefährliche Einheit, die wenn sie ihre Feuerkraft aktiviert schnell die Gegnerbasis komplett zerstören kann.

Da das Mutterschiff als Einheit gesehen wird ist es aber auch möglich das Schiff zu zerstören, auch wenn nur unter hohem Aufwand, wegen der starken Panzerung.

 

Kluft:

Die Kluft stellt die Superwaffe der Aliens dar, die wir ihr Name schon sagt irgendwo auf der Karte eine riesige Kluft erscheinen lässt und so hohe Schäden, besonders bei Gebäuden, anrichtet.

Die Kluft ist die stärkste Superwaffe im ganzen Spiel, besitzt aber auch die längste Nachladezeit.